Изначально проблема сворачивания окна приложения в трей возникла с программой Songbird. Для плеера эта способность довольно таки удобная, а дополнения к нему, добавлявшие данный скилл, по неведомой причине заброшены разработчиками и с текущими версиями программы работать не хотят.
Погуглив и помучив себя и компьютер попытками прикрутить к плееру подобные расширения предназначенные для Firefox или Thunderbird, решила не выделываться, а заюзать известный костыль.
Костыль называется Alltray. Это малюсенькая программулина, позволяющая свернуть в трей вообще любое приложение. Штука далеко не непогрешимая, но вполне юзабельная.
Устанавливается в убунте стандартно с помощью sudo aptitude install alltray. Затем при запуске щелчком на иконке в меню или с помощью команды alltray из терминала получим вот такое окошко:
Это всё. То есть из работы программы в графическом режиме показать больше нечего, а впрочем и не нужно. После появления этого окошка остаётся либо, как и предлагается, кликнуть по окну программы, которую требуется закинуть в трей, либо отказаться нажав соответствующую и единственную кнопку.
Если отмены не было, то в трее появится иконка соответствующего приложения, а при нажатии на кнопку "закрыть" на окне этой программы, она будет сворачиваться, а не закрываться.